Ekspertvejledning til transkriptom-analyse og professionel assistance til dit eksperiment.
Hos Amplexa Genetics specialiserer vi os i at tilbyde omfattende løsninger til afdækning af transkriptomer fra alle typer af biologiske prøver. Amplexa Genetics har erfaring fra forskellige videnskabelige områder, teknikker og bioinformatiske tilgange til at afdække transkriptomsprofilen af biologiske prøver, både i bulk og på enkeltcelle-niveau. Vi tilbyder både komplette løsninger og samarbejdsprojekter.
Bulk RNA-sekventering er en sikker teknik til at afdække den overordnede transkriptionelle profil af en prøve.
Uanset om du er interesseret i at afdække de transkriptionelle konsekvenser af dit loss-of-function eksperiment, eller identificere transkriptionelle regulatorer, kan bulk RNA-sekventering være en teknik, der leverer klare data og let fortolkelige resultater.
Vi anbefaler at vælge bulk RNA-sekventering til direkte sammenligninger mellem to eller flere relativt internt homogene tilstande, da metoden effektivt fanger de samlede transkriptomiske forskelle mellem grupper.
Teknikbeskrivelse: Bulk RNA-sekventering er nyttig til identifikation af transkripter i en homogen, isoleret prøve. Bulk RNA-seq tilbyder dybdegående afdækning af differentielt udtrykte gener mellem to eller flere biologiske tilstande.
Single cell sekventering har potentialet til at afdække heterogene molekylære mekanismer, som ellers ville være skjult i bulk RNA sekventering, ved at sekventere transkriptionsniveauerne i tusindvis af enkelte celler samtidigt.
Amplexa Genetics tilbyder in-house løsninger både til forberedelse af cDNA libraries gennem 10X Genomics platformen og bioinformatisk ekspertise til analyse og fortolkning.
Vi anbefaler at vælge single cell sekventering, når viden om ikke-homogene cellepopulationer er central, da teknikken vil øge opløsningen og forbedre de fortolkede resultater.
Teknikbeskrivelse: Single cell-teknikker er metoder til at analysere udtryksprofilen på enkeltcelleniveau frem for at blande alle celletyper som i bulk-analyser.
Vores services inden for bioinformatik hjælper kunder med at fremme deres forskning inden for forskellige områder, herunder mikrobiologi og grundforskning i stamcelle-regeneration.
Vi tilbyder en komplet pakke, der spænder fra hjælp til opsætning af dit eksperiment og fortolkning af de analyserede resultater samt generering af publicerbare figurer. Vi anerkender også forskernes ønske om at lave deres egne fortolkninger af dataene og tilbyder derfor en hurtig og nem løsning til sikker dataoverførsel, hvis den fulde bioinformatiske service ikke er relevant.
Teknikbeskrivelse: Amplexa Genetics vil organisere de nye data og kombinere dem med databaser, gennem statistik og udpege vigtige fund, der kan bruges til at drage konklusioner inden for diagnostik og forskning. Den specifikt ønskede service aftales ved et indledende møde.