Childhood Epilepsy panelet er relevant i de tilfælde, hvor epilepsi er det primære symptom. 25 % af epilepsitilfældene har deres debut i barndommen, især den tidlige barndom. Childhood Epilepsy Panel inkluderer mere end 100 gener der er involveret i udviklingen af epilepsi med tidligt indsættende, epileptisk encefalopati eller udviklingsmæssig epileptisk encefalopati.
Den nuværende version indeholder 110 gener. Panelet evalueres og opdateres regelmæssigt. For mere information om panelets indhold, klik på ikonet GENLISTE.
Childhood Epilepsy Panel udføres ved hjælp af Next Generation Sequencing (NGS), en avanceret teknik, der tilbyder dyb, storstilet dechifrering af genomet. Teknikken har revolutioneret genetikken ved at muliggøre forskellige tilgange til high-throughput, skalerbar sekventering.
Paneler kan inkludere både kodende, ikke-kodende og regulatoriske genomiske regioner sekventeret til en dybde på minimum 20. Alle kodende regioner analyseres +/- 10 basepar fra exon-intron grænsen.
Data analyseres og annoteres i vores state-of-the-art, lokalt udviklede bioinformatiske pipeline, hvor industristandard software og machine learning algoritmer integreres for at levere den mest omfattende dataanalyse. Igennem hele workflowet sikrer standardiserede kvalitetskontroller konsistente, valide og nøjagtige resultater. Et væld af professionelle, kurerede databaser er integreret i vores pipeline, herunder, men ikke begrænset til, gnomAD, ClinVar, Omim, HGMD, RefSeq og DBSNP. Det sikrer variantklassifikationer med høj sikkerhed. Desuden er flere analyseværktøjer integreret i variantklassifikationen, såsom SIFT, PolyPhen, MutationTaster, AION, SpliceFinder m.fl. Alle kvalitetsvurderingsmålinger er tilgængelige efter anmodning. I tilfælde af manglende indhentning af data fra specifikke genomiske målregioner inden for et panel vil du blive underrettet.
Testen udføres som dataudtræk (virtuelt målrettet panel) fra hele exome-data.
Chemistry: Twist Biosystems Human Core Exome
Hardware: Illumina Novaseq 6000 Sequencer
Data processing: Variant calling and filtering is performed with an in-house bioinformatic pipeline.
Metrics: Average read depth >100-fold. On target coverage >97% at a >20-fold read depth.
Ved at bestille en analyse hos Amplexa Genetics A/S, bekræfter rekvirenten at have indhentet det nødvendige informerede samtykke til udførelsen af de anmodede analyser og accepterer vilkår og betingelser for Amplexa Genetics. En rekvisition i papirkopi eller en e-mail med angivelse af den specifikke analyse sammen med modtagelse af en prøve betragtes som en ordre til at foretage analysen.
Fra bestillingsdagen er omløbstiden 5 uger.